# 消化肿瘤队列公共数据

## 肠癌单细胞数据

* GSE132465（Samsung Medical Center）
* GSE144735

## 肠癌肝转移单细胞数据

* GSE178318（人）
* GSE225857（人）
* GSE110009（人）
* GSE217414（10X Genomics Visium空间转录组）
* GSE298084（人CD45+）
* GSE234804（人类器官+小鼠）
* GSE200813（人PDX+小鼠，scATAC-seq）
* GSE189987（鼠+不同时间）

## 食管癌队列

* TCGA\_ESSC
* GSE53625
* GSE53622
* GSE53624
* GSE47404

## 胃癌队列

* TCGA\_STAD
* GSE13861
* GSE14208
* GSE15459
* GSE183136
* GSE26253
* GSE26899
* GSE26901
* GSE28541
* GSE29272
* GSE34942
* GSE38749
* GSE57303
* GSE62254
* GSE84426
* GSE84433
* GSE84437

## 结直肠癌队列

* TCGA\_COAD/READ
* CRC patients metacohort（HG-U133\_Plus\_2 Array microarray Affymetrix平台）
  * 包含GSE14333, GSE143985, GSE17536, GSE17537, GSE33114, GSE38832, GSE39582
  * <https://zenodo.org/records/13303050>
  * <https://github.com/BigaSpinosaLab/RESOURCES_CRC_metacohort_generation/tree/main>
* GSE39582
* GSE17536
* GSE17537
* GSE17538
* GSE29621
* GSE38832
* GSE71187
* GSE87211
* GSE10658
* GSE40967

## 结直肠癌转移队列

* 结直肠癌肝转移组织芯片：GSE28702、GSE41568
* 结直肠癌肝肺转移组织芯片：GSE41258、GSE68468
* 结直肠癌肝转移RNAseq：GSE145432
* 结直肠癌原发灶配对肝转移芯片：GSE49355
* 结直肠癌原发灶配对肝转移RNAseq：GSE213402、GSE255163
* 原发灶配对癌旁配对转移灶RNAseq：GSE50760
* HT29体内字发转移：GSE153016

## 肝癌队列

* TCGA\_LIHC
* ICGC\_LIRI
* GSE10141
* GSE14520
* GSE27150
* GSE54236
* GSE116174
* GSE144269
* GSE104580
* GSE109211