💾Incucyte细胞功能检测

By Kaiyi

划痕实验

肿瘤球与肿瘤球侵袭

免疫细胞杀伤

细胞追踪(Random migration/Wound healing)

  • 96孔板铺板2000-3000个细胞,10倍镜,每隔15分钟拍照,持续24h

  • 导出AVI格式视频:Export > As displayed > Next, select the wells to export > Next, select timepoints > Next, select folder, choose type of file: AVI no compression > Export

  • 按照User Manual进行文件夹设置。C盘下需要有celltraxx_system和celltraxx_data两个文件夹,后者用来存放AVI视频文件。

  • 按照User Manual指引,在ImageJ中安装celltraxx插件

  • 点击ImageJ-Plugins-Macros-celltraxx imagej macro

  • 设置各项参数,包括是否是Wound healing mode,Gaussian filter radius,Smallest cell diameter, Largest cell diameter,Cutting cell diameter等。可以拖动紫色框限定分析的范围(划痕模式可以只选前沿)。

  • 查看自动分割的结果,进行微调以及update。

  • 参考文献:

    • Automated tracking of cell migration in phase contrast images with CellTraxx

    • Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover distinct cellular subtypes involved in neural invasion in pancreatic cancer

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