质粒/shRNA/RNP脂质体转染
By Kaiyi Fu
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铺板适量细胞,培养24h,直至70-90%融合;
首次实验可以每组准备2个复孔,用不同lipo3000浓度进行转染;
预热培养基,将培养基更换为新鲜培养基;
每孔准备2个EP管:
管1:125μL Opti-MEM + 2.5 μg 质粒DNA + 5μL P3000(2μL/μg DNA,如果是siRNA不用加),混匀;
管2:125μL Opti-MEM + 3.75/7.5μL lipo3000,混匀;
向lipo3000所在EP管加入DNA,室温孵育15min;
将DNA-lipo复合物加入细胞,可不换液;
接种2*10^5细胞/孔(MC38长得不快,可以加到5*10^5)于24孔板中,加入500μL含血清DMEM培养基,培养24h,至70-80%融合
其他孔板的细胞密度见下表
提前6-8h用Opti-MEM饥饿处理需要转染的细胞,以提升转染效率
配置质粒溶液:取若干EP管,每管加50μL Opti-MEM培养基与1μg DNA(公司给的是500ng/μL,加2μL即可,可适量增大剂量),混匀。【注意分组:需要有空白组,NC,GAPDH,HPD的不同分组】
配置转染试剂:取若干EP管,每管加入50μLOpti-MEM与2-5μL的Lipo2000,混匀,室温放置5min。
另取离心管,将转染试剂滴加至shRNA质粒溶液中。轻柔混匀,室温放置20min。
等待间隙,取10mL DMEM培养基37℃预热,在加转染试剂前吸掉原有培养基,用PBS洗一遍,加入400μL无血清DMEM培养基。
将混合液加至含细胞与培养基的孔中,来回轻柔摇晃,充分混合。
孵育4h,更换含血清培养基,去除复合物。
细胞继续培养24-48h。过程中注意换液。
所得细胞用于RNA抽提(24h)+RT-PCR以及Western Blot检测(48h)。
在显微镜下统计表达绿色荧光的细胞,计算转染效率。
收集细胞,进行qPCR以及WB,检测基因表达变化【24h检测RNA水平,48h后检测蛋白水平,中途只换液不传代】。
选择抑制率最高的shRNA进行下一批实验。
在转染前 1 天,将细胞铺至 24 孔板中,1×10^5 个细胞/孔;
准备 2 个 1.5 mL 规格的 EP 离心管,标记为 A 和 B;
A 管中加入:25 µL Opti-MEM TM (赛默飞)、36 pmol Cas9 蛋白(0.6μL*10mg/mL)、36 pmol EasyEdit sgRNA(0.4μL* 100 pmol/μL), 室温孵育 15 min;
B 管中加入:25 µL Opti-MEMTM (赛默飞)、1.5 µL LipofectamineTM 2000 (赛默飞);
将 A 管和 B 管中的溶液轻柔的混合,并在室温下孵育 10 min;
将混合后的溶液加入 24 孔板中,50 µL/孔,将细胞置于 37℃培养箱中孵育;
72 h 后收集细胞,用于测序、INDEL 检测等后续操作。